O antissemitismo tem origem no cristianismo. Por não admitir Jesus como Messias, o judaísmo nega - aos olhos da Igreja cristã - o plano divino de salvação da humanidade. Originalmente considerado o antecedente do cristianismo, o judaísmo, com o tempo, tornou-se sua antítese.

Para Martinho Lutero, os judeus eram os assassinos de Cristo. Em 1543, Lutero publicou o panfleto antissemita "Sobre os judeus e suas mentiras", em que recomendava a expulsão dos judeus das cidades alemãs e a queima de suas casas e sinagogas.